Johnny Test rawak berakhir di pengklonan kereta dan kini beratus-ratus beliau yang munasabah dan pada masa yang sama cuba untuk menangkap makmal klon jahat. Permainan "Johnny Test: Johnny Kesayangan" merujuk kepada strategik. Di sini anda akan menetapkan menara pistol kuat di sepanjang jalan yang membawa ke tengah-tengah makmal. Membina mereka agar mereka berinteraksi antara satu sama lain. Jika menara yang bukan untuk memusnahkan musuh, yang kedua akan membuat kesnya ke akhir. Jangan lupa untuk meningkatkan tetapan untuk musuh-musuh yang lebih kukuh.