Bear Banjo, bersama kakaknya, tinggal di kedalaman hutan. Sebagai satu hari watak kami bangun dan mendapati bahawa adik perempuannya hilang. Sekarang dalam permainan Banjo-Kazooie, kami akan membantu dia mencarinya. Untuk bantuan, watak kami beralih kepada burung ajaib Kazue. Selepas upacara magis, dia menangkap jejak dan terbang bersama-sama. Sekarang anda sedang berjalan wira itu perlu berjalan selepas dia tanpa jatuh di belakang. Berhati-hati dalam perjalanan anda akan mempunyai perangkap dan anda memandu pahlawan perlu memaksa mereka untuk melompat ke atas mereka. Kadang-kadang anda mungkin menghadapi raksasa agresif yang berbeza dan anda perlu memusnahkannya.