Dalam masa yang akan datang, makhluk asing menyerang tanah itu dan cuba merampasnya. Sekarang ramai orang perlu berjuang untuk hidup mereka. Anda dalam permainan Ninjuzi akan membantu perang ninja berani untuk menangkis serangan robot yang ingin menangkap beberapa blok bandar. Wira anda akan bersenjata dengan senjata api. Apabila robot menyerangnya, anda mesti menyasarkan senjata di musuh dan memusnahkan mereka dengan tembakan yang ditujukan baik. Sekiranya objek jatuh dari musuh, anda perlu mengambilnya.