Jerry sentiasa terpaksa melarikan diri dari kucing Tom, dan ini adalah makna semua kartun dengan penyertaan watak-watak ini. Tom and Jerry Run Jerry tidak akan menjadi pengecualian, tetapi tetikus itu mempunyai sekutu kuat dalam pemain yang akan membantu dia melarikan diri dari kucing. Kehidupan Jerry bergantung sepenuhnya pada ketangkasan pengurusan anda. Klik pada pelari kecil supaya dia mempunyai masa untuk melompat ke atas banyak halangan: jurang kosong di antara rak, pinggan mangkuk dan rama-rama. Sekiranya wira tersandung beberapa kali, Tom akan cepat mula melangkah ke belakang, dan kemudian dia akan menangkap rakan-rakan miskin.