Di Jepun purba, pejuang ninja yang terlatih khusus digunakan untuk pengintipan dan kepintaran. Hari ini di Ninja Run Double Jump, anda akan membantu salah seorang daripada mereka menghantar mesej rahsia kepada ketua pesanannya. Wira anda akan berjalan di sepanjang jalan dengan perlahan mendapatkan kelajuan. Dalam perjalanannya, dia akan menemui pelbagai objek berguna dan duit syiling emas yang dia perlu kumpulkan. Anda juga akan menemui pelbagai jenis perangkap. Dengan mengklik pada skrin anda akan membuat lompat watak anda ke atas mereka.