Seorang ahli arkeologi muda bernama Tom menemui sebuah kuil Maya yang terbengkalai di kawasan hutan Amazon. Wira kita memutuskan untuk menyusup ke wilayahnya dan meneroka segala yang ada di sekitarnya. Anda dalam permainan The Mayan Menace akan membantunya dalam pengembaraan ini. Dengan menggunakan kekunci kawalan, anda akan memberitahu watak anda ke arah mana dia harus bergerak. Dalam perjalanannya, perangkap akan muncul sehingga anda harus memotong. Juga ingat bahawa kuil ini dilindungi oleh zombie Mayan yang mati. Anda harus melawan mereka. Dengan bantuan senjata anda, anda akan menghancurkan musuh dan mendapat mata untuknya. Sekiranya piala jatuh dari zombi, anda mesti mengumpulkan semuanya.