Agar watak piksel selamat mencapai kristal hijau pada setiap peringkat permainan Kotak Berkotak, anda mesti bijak dan menggunakan pemikiran logik. Wira berada dalam segi empat sama yang digariskan oleh garis putus-putus, dan dalam ruang kecil di sebelah wira ini terdapat kiub yang diperbuat daripada bahan yang tidak diketahui. Kiub ini, bersama-sama dengan bingkai bertitik, akan sentiasa menemani wira dan membantunya mengatasi halangan tinggi yang tidak dapat dilalui oleh wira. Terpulang kepada anda untuk berjaya menggunakan kiub dan ruang minimumnya untuk mencapai hasil akhir dalam Kotak Berkotak.