Sudah tiba masanya untuk pertempuran lain mutan dalam permainan Mutant Fighting Cup 3. Cawan menunggu pemenangnya dan ia bergantung kepada anda yang akan menjadi. Pemohon anda disediakan oleh komputer, tetapi pada masa depan anda boleh memilih pejuang anda sendiri dengan kebolehan tertentu. Tetapi ia akan berlaku sekiranya berlaku kemenangan, selepas itu anda akan diberi pilihan hadiah dengan sejumlah kristal tertentu. Batu-batu itu akan menjadi cip tawar-menawar untuk membeli kebolehan baru yang boleh anda gunakan untuk serangan-serangan yang paling tidak diinginkan pada musuh. Pilih bijak. Semua kemahiran diletakkan di bahagian bawah skrin, pilihan yang betul bergantung pada kemenangan raksasa dan anda memberikannya.