Mengikut jenis aktiviti, ahli agensi siasatan mistik, di mana Scooby-Doo tidak menduduki tempat terakhir, mendapati diri mereka di tempat yang berbeza. Selalunya mereka berbahaya dan perlu membahayakan nyawa mereka. Dalam permainan Scooby-Doo! `s Over-board anda akan pergi bersama-sama dengan pahlawan di kapal lanun. Lanun sendiri adalah orang yang bertentangan, dan kemudian mereka hanya menjadi pertikaian dan kekacauan bermula di atas kapal. Pasukan itu dibahagikan kepada dua bahagian, yang terletak di hujung bertentangan dek. Mereka menembak senjata api, membuang sabers dan objek berbahaya yang lain. Dalam situasi sedemikian, anda mesti membantu Scooby melintasi geladak.