Seekor foal dunky yang bernama Spirit telah berkembang menjadi kuda jantan yang cantik. Dulu dia berjaya melarikan diri dari peternakan dan sekarang dia bebas. Dia menjelajah dunia, berteman, dan anda akan menemuinya dalam permainan Horse Run 3D, di mana dia bertemu dengan seorang gadis comel dan bersetuju untuk menunggang dirinya sebentar untuk menolong gadis itu melarikan diri dari ibu tirinya yang jahat. Tolonglah pahlawan-pahlawan, kuda harus meluru di jalan-jalan sempit di sebuah bandar kecil. Di jalan raya, anda akan menemui pelbagai rintangan yang perlu dielakkan atau terjun ke atas, mengumpulkan duit syiling dan epal untuk menambah kekuatan haiwan.